Dizem algumas fontes que ela aproxima o homem de Deus. Poderia por ela também se conseguir o Elixir da Longa Vida, que prolongaria a vida indefinidamente. Tentativas de sua preparação foram feitas por vários alquimistas, europeus e árabes, sendo que o conceito da Pedra Filosofal não existe dentro da alquimia desenvolvida pelos chineses.
Sua aparência, de acordo com textos alquímicos, varia entre a cor vermelha e branca. Uma pedra branca seria imperfeita, diferente da pedra vermelha, que seria uma Pedra Filosofal "completa". Alguns destes relatos antigos e medievais deixam pistas da aparência da pedra vermelha, especificando seu tom alaranjado, cor de açafrão. Descrevem-na como também um intermédio de vermelho e roxo. O peso é mencionado como pesado como ouro, e solúvel em qualquer líquido.
Michael Maier figura a pedra geometricamente: "Faça de um homem e uma mulher um círculo, em seguida, um quadrado; fora do este um triângulo; fazer novamente um círculo, e você terá a Pedra dos Sábios Assim é feita a pedra, que não podes descobrir, a menos que você. , através de diligência, aprender a compreender este ensinamento geométricas.
Somente uma pessoa é datada de ter conseguido obter a Pedra, o francês Nicolas Flamel. Viveu no século XVI. Segundo o que se conta, Flamel encontrou um dia em seus arquivos um texto enigmático, e mesmo o estudando muito, não conseguia dizer sobre o que se tratava. Quando viajava por Santiago, na Espanha, encontrou um judeu que disse para ele que o texto travava sobre alquimia e cabala, e através dele teria conseguido produzir com sucesso a Pedra Filosofal. Produziu ouro, tendo financiado com ele várias obras de caridade, construído igrejas e hospitais.
Poderia também ser uma metáfora para o desenvolvimento filosófico do alquimista, sendo a Pedra Filosofal a obtenção de um amplo conhecimento e sabedoria.
Em alquimia existe a Magnum Opus ("Grande Obra" em latim) seria uma área dedicada a preparação da Pedra Filosofal. A preparação obedeceria quatro etapas: Nigredo, albedo, critinitas e rubedo.
